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Eppendorf 5425是一款非常經(jīng)典且高性能的微量高速冷凍離心機,其MAX 轉(zhuǎn)速可達14,700 rpm(約21,130 x g),廣泛應用于分子生物學、細胞生物學、生物化學和臨床診斷等領域。它的主要特點是體積緊湊、運行安靜、制冷快速且控溫精準。以下是一些典型的使用案例介紹,您可以根據(jù)這些案例來理解它適合在哪些實驗步驟中發(fā)揮作用。
一、艾本德5425臺式微量離心機分子生物學實驗
這是5425最核心的應用領域。
1、質(zhì)粒DNA提取
(1)步驟:在堿裂解法提取質(zhì)粒的多個步驟中都需要離心。
(2)具體操作:
菌體收集:取1-2 mL過夜培養(yǎng)的菌液,使用1.5 mL或2.0 mL離心管,在8,000 - 12,000 rpm條件下離心1分鐘,棄上清,收集菌體。
沉淀雜質(zhì):在加入溶液II和溶液III后,會產(chǎn)生蛋白質(zhì)和基因組DNA的沉淀。此時需要12,000 - 14,000 rpm離心5-10分鐘,將沉淀緊密壓在管底,以便將上清液(含質(zhì)粒DNA)轉(zhuǎn)移到新的離心管中。
沉淀DNA:在上清中加入異丙醇或乙醇沉淀質(zhì)粒DNA時,需要在4°C預冷條件下,以MAX 轉(zhuǎn)速(如14,000 rpm)離心15-30分鐘,以確保微量的DNA能被沉淀下來。
(3)為何需要5425:步驟多,需要頻繁離心;沉淀DNA時需要高速和冷凍功能以防止樣品過熱并提高沉淀效率。
2、RNA/DNA純化
(1)步驟:使用商品化試劑盒(如Qiagen, Thermo Fisher的系列產(chǎn)品)進行核酸純化時。
(2)具體操作:在結(jié)合、洗滌步驟中,通常需要短時高速離心(如12,000 rpm, 30-60秒),將液體甩過純化柱。洗脫時,為回收率,有時也會進行短暫高速離心。
(3)為何需要5425:快速、高效的離心能確保液體通過膜,避免殘留,保證純化和回收效率。
3、PCR產(chǎn)物純化、酶切反應后處理
(1)步驟:在PCR反應后或酶切反應后,可能需要去除多余的引物、dNTPs或酶等。
(2)具體操作:使用純化試劑盒時,離心步驟與上述RNA/DNA純化類似。簡單沉淀蛋白質(zhì)時,可能需要4°C, 14,000 rpm離心10分鐘。
二、艾本德5425R冷凍離心機蛋白組學與生物化學實驗
1、細胞/組織裂解物中沉淀蛋白質(zhì)或細胞碎片
(1)步驟:在提取總蛋白時,需要將細胞裂解液中的不溶物(如細胞膜、核酸等)去除。
(2)具體操作:將裂解后的樣品在4°C條件下,以12,000 - 14,000 rpm離心15-20分鐘。上清即為可溶性總蛋白,沉淀棄去。
(3)為何需要5425:低溫控制至關重要,可以防止蛋白質(zhì)在離心過程中降解或變性。5425的快速制冷能迅速將轉(zhuǎn)子降溫至4°C。
2、免疫沉淀/共沉淀后的珠子清洗
(1)步驟:在免疫沉淀實驗中,需要多次洗滌結(jié)合了抗原-抗體復合物的Protein A/G珠子。
(2)具體操作:每次加入洗滌緩沖液后,需要進行短時低速離心(如3,000 - 5,000 rpm, 30秒),使珠子沉降到管底,然后小心吸棄上清。
(3)為何需要5425:雖然轉(zhuǎn)速不高,但需要離心機運行平穩(wěn),防止將松散的珠子沉淀重新打散。5425的加速和減速曲線平滑,非常適合此類操作。
三、常規(guī)細胞培養(yǎng)
1、細胞傳代培養(yǎng)
(1)步驟:消化下來的細胞需要離心收集并重懸。
(2)具體操作:將含有細胞的培養(yǎng)基轉(zhuǎn)入15 mL錐形離心管(需配用15 mL轉(zhuǎn)接器),在室溫或4°C條件下,以1,000 - 1,500 rpm離心5分鐘,使細胞溫和地沉淀下來,棄去上清(含胰酶等),加入新鮮培養(yǎng)基重懸。
(3)為何需要5425:對于貼壁細胞,離心力不能過大,否則會損傷細胞。5425可以精確設置較低的轉(zhuǎn)速,并且運行非常平穩(wěn),對細胞友好。
2、收集細胞沉淀用于后續(xù)分析
(1)步驟:需要提取細胞內(nèi)的核酸或蛋白時,先離心收集細胞。
(3)具體操作:取少量細胞懸液,使用1.5/2.0 mL離心管,在4°C條件下,3,000 - 5,000 rpm離心5分鐘,棄上清,得到細胞沉淀。
四、總結(jié)與關鍵特性
1、通過以上案例,我們可以總結(jié)出Eppendorf 5425離心機的核心優(yōu)勢:
2、高速與高離心力:能應對絕大多數(shù)分子生物學實驗的沉淀需求。
3、精確的溫控:制冷功能是保證對溫度敏感樣品(如RNA、蛋白質(zhì))活性的關鍵。
4、多功能性與兼容性:通過搭配不同的轉(zhuǎn)子和適配器,可以處理從0.2 mL PCR管到15 mL錐形離心管的各種規(guī)格樣品。
5、操作便捷與人性化設計:快速的升/降速、Short-Spin功能、安靜的運行噪音,都大大提升了實驗效率和舒適度。