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QuantStudio 1是一款基礎、緊湊且易于使用的實時熒光定量PCR儀,其核心功能是進行精確的核酸定量和檢測。 它是一款非常適合常規分子生物學實驗室的入門級或主力機型。以下是它可以完成的主要實驗類型,從常見到更高級的應用:
一、賽默飛QuantStudio1實時熒光定量PCR核心與常用應用
1、基因表達分析
描述:這是qPCR經典的應用。通過檢測特定基因的mRNA轉錄本水平,來研究基因在不同條件(如藥物處理、疾病狀態、不同組織、不同發育階段)下的表達量變化。
實驗流程:通常需要先將RNA反轉錄為cDNA,再進行qPCR。
輸出結果:相對定量(如2^-ΔΔCt法),比較處理組與對照組的基因表達差異。
2、定量
描述:用于精確測定樣品中特定DNA或RNA序列的拷貝數或濃度。
實驗流程:需要構建一個已知濃度的標準品(通常是質粒DNA或合成的寡核苷酸)梯度曲線,通過待測樣品的Ct值與標準曲線對比,計算出量。
輸出結果:拷貝數/微升、克當量等。
3、微生物檢測與病原體鑒定
描述:快速、靈敏地檢測樣品中是否存在特定的病原體(如病毒、細菌、真菌)。這在臨床診斷、食品安全和環境監測中非常重要。
例子:病毒載量檢測(如HPV、HIV、流感病毒)、食源性致病菌(如沙門氏菌、李斯特菌)的篩查。
4、基因分型
描述:利用等位基因特異性探針或染料,鑒別樣本的基因型,例如單核苷酸多態性(SNP)、插入/缺失突變等。
應用:遺傳病篩查、藥物基因組學、法醫學鑒定、轉基因生物檢測等。
二、賽默飛QuantStudio1實時熒光定量PCR其他支持的應用
1、高分辨率熔解曲線分析
描述:在PCR結束后,通過緩慢升溫并監測熒光信號的變化,根據DNA片段熔解溫度(Tm)的差異來區分不同的序列。QuantStudio 1支持HRM功能。
應用:
SNP分型:無需特異性探針,成本較低。
突變掃描:快速篩查未知突變。
甲基化分析:經過重亞硫酸鹽處理的DNA,其甲基化狀態會影響Tm值。
2、microRNA表達分析
描述:由于miRNA片段很短,需要特殊的莖環結構引物或加尾法來進行反轉錄和擴增,但其核心檢測原理依然是qPCR。QuantStudio 1可以勝任。
3、細胞因子表達譜分析
描述:在免疫學研究中,同時檢測多種細胞因子mRNA的表達水平,以了解免疫反應的狀態。
三、技術特點與優勢
1、檢測化學:支持SYBR Green I 染料法和TaqMan 探針法。這兩種是最主流的qPCR化學方法,覆蓋了絕大多數應用場景。
2、通量:通常配備96孔板模塊,一次最多可運行96個反應。
3、軟件:配備直觀的QuantStudio Design and Analysis 軟件,可輕松進行實驗設置、數據采集和結果分析(包括相對定量、定量、熔解曲線分析和基因分型)。
4、緊湊設計:占地面積小,非常適合空間有限的實驗室。
四、總結
賽默飛QuantStudio 1實時熒光定量PCR系統是一款功能全面、可靠耐用的基礎型qPCR儀。
1、它非常適合進行:
常規的基因表達差異分析
病原體定量
基礎的SNP分型和突變掃描
教學和標準化質檢流程
2、它的局限性(與更高階型號相比):
通常只有一個熒光檢測通道,因此不能進行多重PCR(即在一個反應管內同時檢測多個目標基因)。高階型號如QuantStudio 3/5/7有多個通道。
不具備更復雜的溫區模塊,如FlexFlex模塊。
通量固定為96孔,無法像384孔板那樣實現超高通量。
如果您的研究主要涉及上述核心應用,且不需要多重檢測,那么QuantStudio 1是一個非常經濟和高效的選擇。