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技術文章

Thermo賽默飛QuantStudio3實時熒光定量PCR技術參數使用說明書

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QuantStudio 3 是一款緊湊、經濟的96孔板qPCR儀,非常適合常規的基因表達分析、病原體檢測和基因分型等應用。其特點是操作簡便,軟件直觀。


一、賽默飛QuantStudio3實時熒光定量PCR主要技術參數

尺寸(長寬高) 27 cm x 50 cm x 40 cm

重量 35 kg

溫度范圍 4-100°C

運行時間 <30min

通道 4個熒光通道

樣本體積 10-100 μL

變溫速率(模塊、樣本) 6.5°C/秒 3.66°C/秒

容量 1 x 96孔-0.1 ml

顯示器 8英寸彩色 TFT LCD 觸摸屏

激發檢測范圍 500-640 nm

產地 美國


關鍵參數解讀:

1、4通道:意味著一次運行最多可以同時檢測4個不同的靶基因(使用不同熒光染料標記的探針)或者進行多色熔解曲線分析。

2、LED光源與CCD檢測:這種設計使其光學系統非常穩定耐用,無需像鹵鎢燈那樣定期更換。

3、快速的升降溫速率:可以顯著縮短PCR循環時間,提高實驗效率。


二、賽默飛QuantStudio3實時熒光定量PCR使用說明書

1、創建新實驗

在軟件主界面點擊 "New Experiment" (新建實驗)。

2、選擇實驗類型:

(1)Standard Curve (Absolute Quantification):定量,用于計算樣品中模板拷貝數。

(2)Comparative ΔΔCt (Quantitation):相對定量,用于分析基因的相對表達水平。

(3)Melt Curve:熔解曲線,用于鑒定PCR產物的特異性或進行基因分型。

(4)Genotyping:基因分型,專門用于等位基因判別。

3、設置實驗板:

(1)軟件會顯示一個虛擬的96孔板界面。

(2)用鼠標選中孔位,在右側面板為其分配 "Sample Type" (樣品類型),如 Unknown, Standard, NTC等。

(3)為每個孔分配 "Target" (檢測目標),例如 Gene A, Gene B, 內參基因等。你需要先創建這些目標。

(4)為每個"Target"選擇對應的 "Dye" (熒光染料),如 FAM, VIC, ROX, CY5 等。


三、程序設置

點擊 "Protocol" 選項卡,設置PCR循環程序。一個典型的qPCR程序包括:

1、階段1:UNG酶孵育 (可選,防污染)

溫度:50°C

時間:2分鐘

2、階段2:預變性 (Hot Start)

溫度:95°C

時間:2-10分鐘 (根據酶的要求)

3、階段3:PCR循環 (40-45個循環)

變性:95°C, 15秒

退火/延伸:60°C, 1分鐘 (此步驟需根據引物Tm值優化)

在此步驟末采集熒光信號 (對于SYBR Green等染料法)。

4、階段4:熔解曲線分析 (可選,用于SYBR Green實驗)

95°C, 15秒

60°C, 1分鐘

從60°C緩慢升溫到95°C (例如,0.05°C/秒),并持續采集熒光信號。


四、重要注意事項與維護

1、光學校準:建議定期(如每季度或更換實驗場所后)運行光學校準程序,以確保所有熒光通道的檢測準確性。

2、背景熒光校準:在創建實驗時,可以選擇運行"Background Calibration"(背景校準),以消除板子和試劑的本底熒光。

3、ROX參比染料:根據你所使用的qPCR預混試劑類型,在設置"Dye"時,需要正確選擇是否需要ROX染料作為內參,以及其濃度級別(如 Passive Reference ROX, ROX Low, ROX High)。

4、清潔維護:定期用柔軟的干布清潔儀器表面和樣品槽。如果發生污染,可用70%乙醇輕微濕潤的無絨布擦拭。

5、數據備份:定期備份實驗數據。

TEL:18016231680

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