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StepOnePlus是一款功能強大、應用廣泛的入門級到中端qPCR儀。 它結合了可靠性、易用性和靈活性,能夠滿足絕大多數常規qPCR實驗的需求。
一、賽默飛StepOnePlus實時熒光定量PCR可以做哪些實驗?
StepOnePlus的核心功能是實時熒光定量PCR,基于此,它可以完成以下幾大類實驗:
1、基因表達分析
這是qPCR常見的應用。通過檢測特定基因的mRNA轉錄水平,來研究基因在何種條件下、何種組織中表達。
(1)定量: 使用標準品曲線,精確計算樣品中特定mRNA的拷貝數。適用于病毒載量、特定轉錄本豐度等需要絕對數值的研究。
(2)相對定量: 比較不同處理組(如藥物處理 vs 對照組、病變組織 vs 正常組織)之間目標基因表達的相對變化。通常使用ΔΔCt法,需要選擇合適的內參基因(如GAPDH, β-actin)進行歸一化。
2、基因分型
利用qPCR的靈敏度和特異性,對DNA樣本進行快速、準確的基因型鑒定。
(1)SNP分型: 使用等位基因特異性探針(如TaqMan)來區分單核苷酸多態性。
(2)突變檢測: 檢測特定的基因突變,用于遺傳病篩查、癌癥研究等。
(3)轉基因鑒定: 快速鑒定動植物模型或樣品中是否含有轉基因成分。
3、微生物檢測與病原體定量
qPCR是微生物學和醫學診斷中工具。
(1)病毒載量檢測: 如HIV、HBV、HCV、HPV等病毒的定量檢測(用于科研,臨床診斷需在認證實驗室進行)。
(2)細菌/真菌檢測: 快速檢測和定量環境、食品或臨床樣品中的特定病原微生物。
(3)微生物負荷分析: 研究環境中微生物群落的組成和變化。
4、miRNA分析
microRNA是重要的基因表達調控因子。StepOnePlus配合特定的試劑盒(如TaqMan MicroRNA Assays)可以高靈敏度地檢測和定量這些小的RNA分子,用于癌癥研究、發育生物學等領域。
5、蛋白質分析(間接)
通過免疫qPCR技術,將抗體反應與qPCR的放大能力相結合,實現超高靈敏度的蛋白質檢測。雖然不直接檢測蛋白,但qPCR是該技術的關鍵組成部分。
6、染料法和探針法檢測
StepOnePlus支持兩種主流的qPCR化學方法:
(1)SYBR Green染料法: 經濟、簡便,通過檢測雙鏈DNA的總量來定量。需要進行熔解曲線分析以確認擴增產物的特異性。
(2)TaqMan探針法: 特異性更高,適用于多重PCR(在StepOnePlus上通常為2-4重)和SNP分型。通過針對不同目標基因設計不同熒光標記的探針,可以在一個反應管內同時檢測多個目標。
二、賽默飛StepOnePlus實時熒光定量PCR應用在哪些領域?
1、基礎科學研究
(1)分子生物學: 研究基因功能、信號通路、轉錄調控。
(2)細胞生物學: 分析細胞分化、凋亡、應激反應等過程中的基因表達變化。
(3)發育生物學: 研究胚胎發育不同階段的基因表達譜。
(4)神經科學: 分析腦組織中神經遞質、受體等相關基因的表達。
2、醫學與轉化醫學研究
(1)癌癥研究: 檢測癌基因、抑癌基因的表達水平,用于腫瘤分型、預后判斷和藥物靶點研究。
(2)遺傳病研究: 進行攜帶者篩查、突變檢測和基因表達關聯分析。
(3)病原生物學: 研究病原體的感染機制、宿主應答以及抗病毒/抗菌藥物的效果評估。
(4)干細胞研究: 鑒定干細胞標志物,分析分化效率。
3、農業與畜牧科學
(1)動植物育種: 進行分子標記輔助選擇,加快優良品種的選育進程。
(2)轉基因生物檢測: 對農產品進行轉基因成分的定性或定量檢測。
(3)疾病防控: 檢測畜禽、作物中的病原體,如病毒、植物病毒等。
4、食品安全與環境監測
(1)食源性致病菌檢測: 快速篩查食品中的沙門氏菌、李斯特菌等。
(2)食品真偽鑒別: 檢測肉類、魚類等產品的物種來源,防止摻假。
(3)環境微生物監測: 分析水體、土壤中的特定功能微生物或指示病原菌。
三、總結與特點
StepOnePlus的核心特點:
1、通量靈活: 提供96孔板和0.2mL單管兩種反應模塊,適應不同通量需求。
2、易于使用: 軟件界面直觀,實驗設置和數據分析流程化,非常適合實驗室常規使用和教學。
3、性能穩定: 作為賽默飛旗下的經典機型,其熱循環和光學檢測系統穩定可靠,數據重復性好。
4、應用全面: 覆蓋了從基因表達到基因分型的絕大多數qPCR應用場景。
5、需要注意的是:
StepOnePlus是一款較經典的型號,與新的高級qPCR儀(如QuantStudio系列)相比,其在升溫速度、多重檢測能力(顏色數量)、自動化整合等方面可能有所限制。
在進行臨床診斷應用時,需要確保儀器、試劑和操作流程符合當地法規和認證要求。
總而言之,賽默飛StepOnePlus是一款非常出色的“主力"qPCR儀,是眾多分子生物學實驗室的核心設備之一,其應用范圍幾乎涵蓋了所有需要核酸定性和定量分析的科研與工業領域。